Из 1400 работающих на предприятии человек 980 находятся в контакте с вреднодействующими факторами — из омских предприятий здесь самый высокий уровень профзаболеваний.
За 2010 год и первый  квартал 2011 года с подозрением на профзаболевание на "Омскэнергоремонте" выявлено 10 человек (6% от общего числа случаев, выявленных на всех промышленных предприятиях Омска). В основном работники страдают тугоухостью и заболеваниями, вызванными  воздействием промышленных аэрозолей.
Причиной высокого уровня профзаболеваемости специалисты Роспотребнадзора считают неудовлетворительные условия труда работающих, несовершенство технологических процессов, морально устаревшее оборудование, отсутствие эффективных средств индивидуальной защиты, а также недостаточный контроль со стороны администрации предприятия за их использованием.  
Управление Роспотребнадзора по Омской области составило 10 протоколов об административном правонарушении на должностных лиц ОАО ПРП «Омскэнергоремонт». Руководителям предприятия предписано в течение этого года довести параметры вредных факторов  до нормируемых величин, обеспечить сотрудников масками сварщика и антифонами (для защиты органов слуха), сообщает пресс-служба Роспотребнадзора.
«Омскэнергоремонт» занимается ремонтно-эксплуатационными работами на теплоэлектроцентралях Омска.